این عالم ربّانی در روز شنبه ۲ ربیع الاوّل ۱۴۱۹ق (مطابق ۶ تیرماه ۱۳۷۷ش) در اصفهان وفات یافته و در بقعه علّامه مجلسی مدفون شد. شاعر توانا استاد فضل اللّه اعتمادی (برنا) در تاریخ وفات او چنین سروده است: چون مدرس هاشمی شد جانب دارالسّرور ••••• تا شود آسوده از آلام این بیت الحزن آن که مانندش نیارد باب دوران مرد علم ••••• آن که مثل او نزاید مام گیتی اهل فن خامه «برنا» پی سال وفات او نوشت ••••• «عالمی کامل مدرّس بود با خلقی حسن»
